Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2fQ9CY34 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ube2fQ9CY34 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms