Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms