Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Bud23Q9CY21 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bud23Q9CY21 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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