Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nip7Q9CXK8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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