Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mgme1Q9CXC3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mgme1Q9CXC3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms