Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms