Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkrip1Q9CWV6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms