Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU9

Nup37, Nucleoporin Nup37, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup37Q9CWU9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup37Q9CWU9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup37Q9CWU9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup37Q9CWU9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup37Q9CWU9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup37Q9CWU9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup37Q9CWU9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms