Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CWU4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CWU4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms