Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdca4Q9CWM2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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