Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn3Q9CVD2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atxn3Q9CVD2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms