Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rhobtb3Q9CTN4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rhobtb3Q9CTN4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms