Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrxn1Q9CS84 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrxn1Q9CS84 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms