Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ska2Q9CR46 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ska2Q9CR46 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms