Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl28Q9CR40 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms