Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ykt6Q9CQW1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms