Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atp5f1Q9CQQ7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms