Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CQM1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQM1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQM1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQM1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms