Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms