Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ndufb5Q9CQH3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ndufb5Q9CQH3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms