Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms