Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3bQ9CQE1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms