Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trappc5Q9CQA1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc5Q9CQA1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms