Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb3bpQ9CQ82 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms