Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpa3Q9CQ71 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms