Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700029P11RikQ9CQ68 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms