Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4921530L21RikQ9CQ47 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms