Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcab2Q9CQ46 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcab2Q9CQ46 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms