Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg3Q9CPX6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg3Q9CPX6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms