Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe41Q99PV5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms