Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup155Q99P88 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms