Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bco2Q99NF1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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