Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln4Q99NB8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln4Q99NB8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln4Q99NB8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln4Q99NB8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln4Q99NB8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln4Q99NB8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln4Q99NB8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln4Q99NB8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln4Q99NB8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln4Q99NB8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln4Q99NB8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln4Q99NB8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln4Q99NB8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln4Q99NB8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms