Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mrpl43Q99N89 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mrpl43Q99N89 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mrpl43Q99N89 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mrpl43Q99N89 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl43Q99N89 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms