Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pramel1Q99MW3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pramel1Q99MW3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms