Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tdrd1Q99MV1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Tdrd1Q99MV1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tdrd1Q99MV1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms