Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkd1Q99MH6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms