Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms