Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fars2Q99M01 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fars2Q99M01 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms