Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gins4Q99LZ3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gins4Q99LZ3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms