Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q99KU6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q99KU6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q99KU6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q99KU6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q99KU6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q99KU6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q99KU6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q99KU6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q99KU6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q99KU6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q99KU6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q99KU6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q99KU6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q99KU6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q99KU6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q99KU6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q99KU6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99KU6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99KU6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99KU6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99KU6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99KU6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99KU6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99KU6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99KU6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99KU6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99KU6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99KU6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99KU6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99KU6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99KU6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q99KU6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms