Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ciao1Q99KN2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ciao1Q99KN2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ciao1Q99KN2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ciao1Q99KN2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ciao1Q99KN2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ciao1Q99KN2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ciao1Q99KN2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ciao1Q99KN2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ciao1Q99KN2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ciao1Q99KN2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ciao1Q99KN2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ciao1Q99KN2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms