Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ddb2Q99J79 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ddb2Q99J79 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ddb2Q99J79 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ddb2Q99J79 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ddb2Q99J79 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ddb2Q99J79 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddb2Q99J79 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddb2Q99J79 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddb2Q99J79 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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