Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cldn16Q925N4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn16Q925N4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn16Q925N4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn16Q925N4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn16Q925N4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cldn16Q925N4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn16Q925N4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Cldn16Q925N4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn16Q925N4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cldn16Q925N4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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