Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ripply3Q924S9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripply3Q924S9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms