Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b5Q923D4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms