Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clip1Q922J3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Clip1Q922J3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Clip1Q922J3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms