Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp4Q921I6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Sh3bp4Q921I6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Sh3bp4Q921I6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms