Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smarca5Q91ZW3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms