Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trpm2Q91YD4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms