Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Basp1Q91XV3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms